Trưởng thành từ một chiến sĩ tại Ban CHQS huyện Củ Chi, trải qua nhiều nhiệm vụ, từ cán bộ xã đội, Trợ lý Quân lực cấp huyện đến cấp Thành phố, năm 2011, đồng chí Nguyễn Văn Phòng được bổ nhiệm làm Phó Chỉ huy trưởng Động viên của Ban CHQS Quận 1. Với sự nỗ lực phấn đấu, hỏi hỏi không ngừng, anh tiếp tục được tin tưởng giao nhiệm vụ Phó Chỉ huy trưởng, Tham mưu trưởng và cuối năm 2015, trở thành Chỉ huy trưởng Ban CHQS Quận 1.
Để hoàn thành tốt nhiệm vụ chỉ huy cơ quan quân sự địa bàn trung tâm của thành phố năng động hàng đầu cả nước, đồng chí Nguyễn Văn Phòng luôn tích cực nghiên cứu, nắm vững các văn bản, chỉ thị, kế hoạch của cấp trên và các ngành, các cấp có liên quan đến nhiệm vụ quân sự - quốc phòng. Trên cơ sở đó, anh chủ động trao đổi với các đồng chí trong Đảng ủy - Ban CHQS quận, tham mưu giúp Quận ủy, UBND quận tổ chức quán triệt nhiệm vụ quân sự - quốc phòng đến các các cơ quan, đơn vị và cán bộ, chiến sĩ LLVT quận.
Trong chỉ huy đơn vị, đồng chí Nguyễn Văn Phòng chú trọng giữ gìn mối quan hệ đoàn kết gắn bó giữa cán bộ, chiến sĩ trong đơn vị. Anh quan tâm thực hiện tốt trách nhiệm nêu gương của cán bộ, đảng viên, nhất là cán bộ chủ trì đơn vị theo Qui định số 10 của Ban Bí thư Trung ương Đảng. Trong đó, bản thân anh luôn gương mẫu trong công việc lẫn cuộc sống để cán bộ, chiến sĩ noi theo.

Quá trình thực hiện nhiệm vụ, cùng với việc luôn sâu sát đơn vị để kịp thời kiểm tra, đôn đốc, đồng chí Nguyễn Văn Phòng thường xuyên nắm bắt tâm tư nguyện vọng của cán bộ, chiến sĩ, nhất là những đồng chí có hoàn cảnh khó khăn, hay các trường hợp cán bộ mới chuyển công tác về đơn vị, ..., từ đó kịp thời động viên, chia sẻ, chỉ dẫn, tạo điều kiện giúp đỡ để cấp dưới nỗ lực vượt khó, hoàn thành tốt nhiệm vụ. Anh tâm niệm: “Trong công việc phải nghiêm túc, chính qui; còn khi quan hệ anh em ngoài giờ nên tình cảm, gần gũi, giản dị, không quan cách”. Với tính cách đó, anh được cán bộ, chiến sĩ trong Ban CHQS quận tin tưởng, gần gũi, gọi với cái tên trìu mến: Anh Ba, chú Ba.
Với sự gương mẫu, nhiệt huyết, trách nhiệm trong công việc, lối sống giản dị, trong sáng, đồng chí Nguyễn Văn Phòng đã xây dựng mối đoàn kết, thống nhất cao trong tập thể đơn vị. Do đó lúc đơn vị có thực hiện nhiệm vụ gì, dù khó khăn đến mấy, khi chỉ huy đưa ra chủ trương, giải pháp điều được mọi người nhiệt tình ủng hộ. Điển hình là trong 6 tháng đầu năm 2018, LLVT quận phải đảm nhiệm một khối lượng công việc lớn, nhưng dưới sự chỉ huy của Thượng tá Nguyễn Văn Phòng, cán bộ, chiến sĩ đã đoàn kết một lòng; được cấp ủy, chính quyền địa phương tin tưởng ủng hộ; các ban, ngành, đoàn thể phối hợp, hỗ trợ nên Quận 1 đã hoàn thành tốt nhiệm vụ quốc phòng – quân sự địa phương, được Bộ Tư lệnh Thành phố đánh giá cao.
Hơn 7 năm công tác tại Ban Chỉ huy quân sự Quận 1, với sự sâu sát, gương mẫu và trách nhiệm của mình, đồng chí Nguyễn Văn Phòng đã nhận được nhiều bằng khen, giấy khen của Bộ Tư lệnh Quân khu 7, UBND Thành phố và Bộ Tư lệnh Thành phố Hồ Chí Minh. Năm 2017, anh là chiến sĩ thi đua của đơn vị.
Nhận xét về anh, đồng chí Trần Thế Thuận, Chủ tịch UBND Quận 1, người thường xuyên quan tâm đến hoạt động của LLVT quận cho biết: Thượng tá Nguyễn Văn Phòng là một người chỉ huy quyết đoán, năng động, vững vàng, hiệu quả trong xử lý các tình huống. Anh một gương điển hình trong học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh của LLVT Quận 1”.