Được thành lập từ năm đầu của cuộc kháng chiến chống thực dân Pháp xâm lược, trải qua suốt chiều dài 30 năm đấu tranh giải phóng dân tộc với muôn vàn khó khăn, ác liệt; tuy tổ chức, biên chế trong từng giai đoạn có sự thay đổi. Song, nhận thức rõ vai trò của hoạt động công tác Đảng, công tác chính trị tư tưởng (CTĐ, CTCT), cán bộ, chiến sĩ cơ quan Chính trị Chiến khu 8 phát huy tinh thần đoàn kết, kiên cường, dũng cảm, vượt qua mọi gian khổ, hy sinh; bám sát thực tiễn chiến trường và tình hình, nhiệm vụ của LLVT; chủ động, sáng tạo, vừa tham mưu cho Đảng ủy, Bộ chỉ huy Chiến khu lãnh đạo, chỉ đạo, vừa trực tiếp hướng dẫn, triển khai thực hiện có hiệu quả hoạt động CTĐ, CTCT trong mọi điều kiện…
Sau ngày thống nhất đất nước, trước yêu cầu nhiệm vụ xây dựng Quân đội, Cục Chính trị Quân khu 8 và Cục Chính trị Quân khu 9 được sáp nhập và tổ chức thành Cục Chính trị Quân khu 9. Dưới sự lãnh đạo, chỉ đạo trực tiếp của Đảng ủy, Bộ Tư lệnh Quân khu 9, sự phối hợp, giúp đỡ của các đơn vị bạn, của cấp ủy, chính quyền và Nhân dân các địa phương, các thế hệ cán bộ, chiến sĩ Cục Chính trị và ngành Chính trị Quân khu 9 tiếp tục kế thừa và phát huy những thành tích, truyền thống vẻ vang mà các thế hệ đi trước tạo dựng, hoàn thành xuất sắc chức năng, nhiệm vụ, góp phần quan trọng để Đảng ủy, Bộ Tư lệnh Quân khu 9 lãnh đạo, chỉ đạo, tổ chức thực hiện thắng lợi nhiệm vụ quân sự, quốc phòng, bảo vệ Tổ quốc trên địa bàn Quân khu thời kỳ đẩy mạnh công nghiệp hóa, hiện đại hóa và hội nhập quốc tế.