Những ngày đầu mới thành lập, dù còn nhiều khó khăn về cơ sở vật chất, tổ chức biên chế chưa được kiện toàn, nhưng tập thể Viện Kiểm sát Quân sự Quân khu luôn đoàn kết, quyết tâm vượt qua khó khăn, thực hiện tốt công tác chuyên môn nghiệp vụ, tập trung vào những khâu trọng yếu, phục vụ nhiệm vụ chính trị, đảm bảo an ninh trật tự ở vùng mới giải phóng, cố gắng hoàn thành tốt chức trách nhiệm vụ được giao.
Trải qua hơn 45 năm hình thành và phát triển, Viện Kiểm sát Quân sự Quân khu luôn phát huy truyền thống “Tinh thông pháp luật - bản lĩnh, kỷ cương - trách nhiệm, nêu gương - thi đua quyết thắng". Đội ngũ cán bộ, kiểm sát viên ngày càng trưởng thành về nghiệp vụ và có bản lĩnh chính trị vững vàng. Với những kết quả đạt được, đơn vị được Chủ tịch nước, Thủ tướng Chính phủ, Bộ Quốc phòng ghi nhận, đánh giá cao trong các phong trào thi đua; trong phát hiện, khởi tố, điều tra các vụ án, góp phần vào sự nghiệp xây dựng Quân đội, củng cổ quốc phòng và bảo vệ Tổ quốc.
Để hoàn thành tốt nhiệm vụ trong giai đoạn mới, Viện Kiểm sát Quân sự Quân khu tiếp tục tăng cường sự lãnh đạo của Đảng các cấp, vì đây là nhân tố quyết định hiệu quả hoạt động của viện; thường xuyên kiện toàn tổ chức bộ máy, xây dựng đội ngũ cán bộ, kiểm sát viên trong sạch, vững mạnh; xác định nguyên tắc tập trung thống nhất lãnh đạo trong ngành Kiểm sát; phát huy vai trò, trách nhiệm của người đứng đầu trong thực hiện chức năng, nhiệm vụ; không ngừng đổi mới phương pháp công tác thực hành quyền công tố và kiểm sát hoạt động tư pháp, tạo sự chuyển biến tích cực trong công tác thực hiện chức năng, nhiệm vụ.