Năm 2020, Thượng tá Đỗ Duy Phú được điều động về công tác tại Ban CHQS huyện Chơn Thành, Bộ CHQS tỉnh Bình Phước. Ở đơn vị mới, anh thường xuyên làm tốt công tác tham mưu, đề xuất cho Đảng ủy, Ban CHQS huyện nhiều giải pháp và cách làm hay, thiết thực nhằm triển khai hiệu quả các chỉ thị, nghị quyết của Đảng.
Trên cương vị Chính trị viên, anh thường xuyên tham mưu cho Đảng ủy Ban CHQS huyện những giải pháp thiết thực, hiệu quả nhằm nâng cao chất lượng công tác quân sự, quốc phòng, công tác phòng, chống dịch Covid-19, công tác tuyển quân, thực hiện các chính sách hậu phương Quân đội. Vì vậy, trong những năm gần đây, Ban CHQS huyện Chơn Thành luôn là đơn vị điển hình thực hiện tốt công tác quân sự - quốc phòng của lực lượng vũ trang tỉnh.
Trong công tác lãnh đạo, chỉ đạo, chủ động nắm bắt tình hình đơn vị, làm tốt công tác tuyên truyền, vận động cán bộ, chiến sĩ DQTV thực hiện thắng lợi các nhiệm vụ được giao. Đồng thời, luôn xây dựng cho mình tác phong làm việc khoa học, tỉ mĩ với những kế hoạch, mục tiêu cụ thể trong công việc.
Thường xuyên tự học hỏi, trau dồi kinh nghiệm cho bản thân qua thủ tưởng cấp trên, đồng nghiệp, sách báo, tài liệu. Nêu gương trong học tập và làm theo tư tưởng, đạo đức, phong cách Hồ Chí Minh bằng những việc làm thiết thực, cụ thể như: Chấp hành tốt nội quy, quy định của đơn vị; có tinh thần trách nhiệm cao trong công việc, giữ gìn lối sống giản dị, quan tâm cán bộ, chiến sĩ DQTT trong cơ quan đơn vị, luôn là trung tâm đoàn kết, hòa đồng, gần gũi với mọi người, tận tình hướng dẫn cấp dưới về phương pháp, tác phong, cách thức làm việc khoa học, quan tâm động viên kịp thời những trường hợp gia đình có hoàn cảnh khó khăn…
Năm 2021, Ban CHQS huyện Chơn Thành được Bộ Tư lệnh Quân khu tặng danh hiệu “Đơn vị Quyết thắng”. Đảng bộ Quân sự huyện đạt danh hiệu trong sạch vững mạnh và đơn vị vững mạnh toàn diện. Trong thành tích chung của đơn vị, có những đóng góp của Thượng tá Đỗ Duy Phú.